Un sistem de electroforeză este format din două componente principale: o sursă de alimentare și o cameră de electroforeză. Sursa de alimentare furnizează energie.„Puterea”, în acest caz, este electricitatea.Electricitatea care vine de la sursa de alimentare circulă, într-o direcție, de la un capăt la celălalt al camerei de electroforeză.Catodul și anodul camerei sunt cele care atrage particulele încărcate opus.
În interiorul camerei de electroforeză, este o tavă - mai precis, o tavă de turnare.Tava de turnare este formata din urmatoarele piese: placa de sticla care merge in partea de jos a tavii de turnare.Gelul este ținut în tava de turnare.„Piaptenul” seamănă cu numele său. Pieptene este plasat în fante pe lateralul tăvii de turnare. Se pune în fante ÎNAINTE de turnare a gelului fierbinte, topit.După ce gelul se solidifică, pieptene este scos.„Dinții” pieptenelor lasă mici găuri în gel pe care le numim „puțuri”.Puțurile sunt făcute atunci când gelul fierbinte, topit, se solidifică în jurul dinților pieptenului.Pieptene este scos după ce gelul s-a răcit, lăsând godeuri.Sondele oferă un loc pentru a pune particulele pe care doriți să le testați.O persoană trebuie să fie foarte atentă să nu perturbe gelul atunci când încarcă particulele.Crăparea sau spargerea gelului va afecta probabil rezultatele.